Kontroversiella religiösa talare kan tvinga män och kvinnor att sitta separat, säger universitetschefer.
Universities UK, gruppen av rektorer som inkluderar Nottinghams professor David Greenaway, sa att könssegregering är acceptabel.
Men aktivister hävdar att rektorerna stödjer sexism och könsapartheid.
Skyltar som riktade män och kvinnor i olika riktningar orsakade kontroverser vid Leicester Uni tidigare i år
Universities UK publicerade en rapport som presenterar det hypotetiska fallet med en ultraortodox religiös talare som kräver könssegregering.
Det fortsätter med att säga att sexuell segregation skulle vara acceptabel i detta scenario, så länge kvinnorna inte tvingas sitta bakom männen.
Den välkände teoretiske fysikern Lawrence Krauss gick ut ur en segregerad debatt vid UCL tidigare i år
Universiteten i Storbritannien insisterar på att de lyfter fram juridiska skyldigheter och att varje fall måste ses individuellt.
Rapporten följer en rad aktuella kontroverser.
I mars förbjöd UCL en islamisk grupp efter att den organiserat ett påstått segregerat evenemang. En månad senare undersökte Leicester Uni påstådd sexuell segregation vid en offentlig föreläsning som anordnades av det islamiska studentsamhället.
Universities UK tvingades försvara sig efter påståenden att de stödde könssegregation
En rapport tidigare i år av Student Rights, en studentjämställdhetsgrupp, hävdade att segregation vid studentevenemang var utbredd.
Nicola Dandridge, verkställande direktör för Universities UK, sa: Vägledningen handlar inte om rättigheterna eller felen med att separera en händelse efter kön. Istället lyfter den fram de juridiska och andra faktorer som universiteten måste överväga om de tar itu med de speciella omständigheterna i denna fallstudie.
